Nordiska ministerrådet styr institutets verksamhet genom att fastställa beviljningsbrev och genom styrdokument i form av exempelvis ministerrådets vision och olika samarbetsprogram. Ministerrådets generalsekreterare fattar organisatoriska beslut om regerverket i institutionshandboken och exempelvis om vem som anställs som direktör. Direktören har sedan den exekutiva makten och det operativa ansvaret för institutet.
Nordiska ministerrådet tillsätter institutets styrelse, genom medlemsländernas regeringar och departement/ministerier. Styrelsen är ett rådgivande organ med uppgift att bevaka och ge råd till verksamheten utifrån ministerrådets prioriteringar. Styrelsens mandatperiod är 3-årig. Den nordiska representationen i styrelsen är för närvarande: Danmark, Norge, Sverige, Grönland och Åland. Ett fysiskt möte hölls i maj, då även den nya direktören medverka digitalt och ytterligare ett fysiskt möte hölls i november i Svensk Scenkonsts lokaler i Stockholm.
Tjänsten för löpande ekonomisk administration samt löner och bokföring har köpts in av Företagsbyrån på Åland, som även upprättat bokslutet.
Revisionen av institutets räkenskaper och verksamhet, ska enligt det samnordiska revisionsreglementet som fastställts av de nordiska ländernas riksrevisioner, oberoende av Nordiska ministerrådet. I likhet med 2023 har landskapsrevisorn, med hänvisning till hög arbetsbelastning, inte kunnat åta sig revisionen och uppmanat NIPÅ att kontakta revisionsfirman BDO även i år. Revisor Anton Axberg, CGR, vid revisionsfirman BDO, har tillfrågats och därefter utsetts att även i år genomföra revisonen. Det behöver redas ut om revisionskostnaderna borde belasta lanskapsregeringen då de ska stå för revisionen och inte bekostas av institutets knappa medel.
Ny inventarielista för institutet har inte upprättats sedan förra året. Personalhandboken genomgår en översyn och kommer att uppdateras under nästa år. Policydokument och uppförandekoder kommer också att inventeras och ses över under nästa år.